基础医学实验中心下设形态学实验中心和机能学实验中心。

形态学实验中心：

 基础医学院形态学实验中心共有实验室18间，其中解剖实验室6间，解剖数码互动实验室1间，显微镜室7间，数码互动显微镜室4间。

 承担课程：基础医学形态实验中心承担了《免疫学》、《医用细胞生物学》、《医学遗传学》、《病原学》、《医学微生物学》、《人体寄生虫学》、《细菌学》、《系统解剖学》、《局部解剖学》、《麻醉解剖学》、《人体影像解剖学》、《组织胚胎学》、《病理解剖学》、《正常人体形态学》、《口腔组织病理学》等课程的实验准备及部分授课，每年平均开课约91个班次，平均学生约39000人次。

 科研：主持自治区级科学研究项目1项（在研），主持校级教改课题2项（1结题、1在研），在国际和国内期刊上发表论文6篇，其中SCI收录1篇，核心2篇，普刊3篇。

机能学实验中心：

 机能学实验中心共有实验室9间，面积约1402m²，共有实验仪器332台，总价值约450万元。

 承担课程：机能学实验中心承担了临床、口腔、麻醉、检验、药学、护理、中西医和卫生检验与检疫等14个专业的《生理学》、《人体机能学》、《机能实验学》、《生物化学与分子生物学》、《人体解剖生理学》等实验课程的准备和教授工作，并承担药学本科毕业生论文指导工作。

 科研：主持自治区级科学研究项目1项（在研），主持自治区级大学生创新课题1项（结题），在国际和国内期刊上发表论文12篇，其中SCI收录3篇，核心期刊7篇，普刊2篇。